| 重要特殊獎項 (2022) 經濟部國家發明創作獎 | |
| 重要特殊獎項 (2021) 國家農業科學獎 | |
| 重要特殊獎項 (2020-09-24) 2020未來科技獎 | |
| 重要特殊獎項 (2019) 2019台灣創新博覽會創新發明獎 | |
| 重要特殊獎項 (2019) 國家新創獎 | |
| 重要特殊獎項 (2018-12) Lecture Award of Asia-Pacific Association of Agricultural Research Institutions (APAARI) | |
| 重要特殊獎項 (2018-12) Outstanding Poster Award of APAARI | |
| 重要特殊獎項 (2018-09) 2018年台灣創新技術博覽會科技部展區重點技術 | |
| 重要特殊獎項 (2018-09) 中華天然藥物學會論文獎 | |
| 重要特殊獎項 (2017) 中華民國雜草學會 優良壁報論文獎 | |
| 重要特殊獎項 (2016(8)) 2016年美洲華人生物學科學會(SCBA)最佳壁報論文獎 | |
| 重要特殊獎項 (2015-06) 2015年美洲華人生物學科學會(SCBA)最佳壁報論文獎 | |
| 重要特殊獎項 (2015) 台灣生醫暨新農業產業選秀大賽新農組潛力新秀獎 | |
| 重要特殊獎項 (2013-11) 第11屆國家新創獎 | |
| 重要特殊獎項 (2013-10) 經濟部智財局國家發明創作獎 | |
| 重要特殊獎項 (2012-11) International Inventor prize
(國際發明家學術國光獎章) | |
| 重要特殊獎項 (2010-2018) 科技部獎勵特殊優秀人才 | |
| 重要特殊獎項 (2010-01) 中研院前瞻計畫(2010 Career Development Award of Academia Sinica) | |
| 重要特殊獎項 (2008-08) 第六屆國家新創獎 | |
| 重要特殊獎項 (2007-02) 白蘭氏第四屆(2007)健康百萬論文獎優良論文指導教授 | |
