Complete Chloroplast Genome Sequence of an Orchid Model Plant Candidate: Erycina pusilla Apply in Tropical Oncidium Breeding

蘭花是一種相當重要的觀賞植物，但是蘭花的相關研究卻相當困難。扇形文心蘭是文心蘭亞屬中生長快速、染色體數量少、基因組大小較小、生長周期較短而且可以在組織培養瓶內完成生長週期的一種蘭花。引此扇形文心蘭可成為很理想的模式植物以及雜交種蘭花的親本。目前遺傳資訊有限，但是葉綠體基因組系統性的分子分析仍然可以提供有用的遺傳學資訊。利用細菌人工染色體(bacterial artificial chromosome, BAC)及次世代定序法(next-generation sequencing, NGS)，可以準確、經濟及高效率的獲得扇形文心蘭葉綠體序列。扇形文心蘭葉綠體基因組與文心蘭及蝴蝶蘭分別有89及84%的相似度。比較這三種蘭花的葉綠體基因組顯示有5個區與有歧異性。相較於蕙蘭族，利用PCR技術檢測樹蘭亞科的19種蘭花在 rps15-trnN區域有高度保留性。因為台灣的商業蘭科植物多樣性，利用分子育種方法鑑別可能可以利用的親本資源相當重要。為了證明扇形文心蘭分類學上的親源遠近以及雜交的一致性，利用4個DNA區域進行36種熱帶文心蘭亞族蘭花的檢測。其結果顯示trnF-ndhJ及 trnH-psbA適合做為系統發生學分析的區域。儘管扇形文心蘭的花朵外型與文心蘭相似,但是卻被證明相較於文心蘭，其在系統發生學上更接近茹氏蘭和劍葉文心蘭。這些結果指出在文心蘭屬育種上，扇形文心蘭葉綠體基因組為雜交研究結果得到了証明。
林崇熙

I-C Pan, D-C Liao, F-H Wu, H Daniell, N D Singh, C Chang, M-C Shih, M-T Chan, C-S Lin (2012) PLoS ONE, 7(4): e34738