廣用質譜訊號處理系統之開發並應用於定性定量蛋白質體學之研究

以質譜儀為基礎之研究策略已被廣泛的應用在蛋白質體學上，而近年來高解析質譜儀的發展則更進一步提昇我們對蛋白體輪廓解析的準確度及靈敏度。目前高解析度質譜方法依據其分析原理具有不同且互補之功能及優點，若能整合不同類型的質譜儀數據則可得到更完整的蛋白體分析結果。而整合不同質譜數據遇到最大的困難在於質譜圖譜的特性與不同的質譜種類，電子元件設計以及所使用之研究策略有關，現今並沒有一個整合的質譜圖譜分析平台可針對不同的圖譜或是研究策略類型提供最佳化的數據處理步驟。為了解決這個問題，我們發展了一個整合各種質譜數據平台之訊號處理軟體UniQua。此軟體可支持大部分的高解析質譜以及蛋白質體學研究策略。使用UniQua可以大幅減少高解析度質譜分析之質量誤差及雜訊干擾使得蛋白質定性定量之準確度及靈敏度大幅提昇。值得一提的是，對於iTRAQ所產生的數據，經由UniQua處理後，不需要專用的iTRAQ定量軟體即可在Mascot中得到準確的定量結果。在程式執行效能部分，UniQua支援平行化異構計算，處理效率可高達每分鐘處理十億位元組（1 gigabyte/min）以上的資料運算通量，同時處理後的數據在沒有犧牲定量及定性準確度外可縮小至10%的資料大小以及可增加後續定量分析之處理效率達50%以上。平台之資訊可由” http://msomics.abrc.sinica.edu.tw/UniQua/ ”獲得。