Catalog of Erycina pusilla miRNA and categorization of reproductive phase-related miRNAs and their target gene families

為了了解扇形文心蘭因具有較短的開花週期的原因,將不同器官及不同發育階段的小片段核醣核酸(small RNAs, sRNAs)進行定序。在本文中，有33個已知的小核醣核酸家族，及其110個小核醣核酸目標降解基因利用生物資訊的方法確定。利用三種不同的策略獲得三個新發現的小片段核醣核酸。其中t0000354小片段核醣核酸藉由水稻序列以及蝴蝶蘭相關研究顯示有相當高讀值的相似度。此片段核醣核酸的目標基因為MADS基因(非冗餘性基因標號30603)，此基因屬於AP3-PI基因族群。扇形文心蘭中最大量的小片段核醣核酸為miR156 (epu-miR156)，其同源基因藉由抑制SQUAMOSA promoter-binding-like (SPL)轉錄因子的表現來保持植物的營養生長時期。扇形文心蘭的15個SPL基因族群已被確認，其中有9個包含epu-miR156的可能目標鍵結位置。小片段核醣核酸epu-miR172的目標基因APETALA2 (EpAP2)基因族群，也被證實是調控發育階段改變的關鍵角色。利用5'RLM-RACE實驗證實epu-miR156和epu-miR172分別調控EpSPL1、2、3、4、 7、9、10、 14及EpAP2-9、 -10、 -11基因群。
林崇熙

Lin CS , Chen JJ, Huang YT, Hsu CT, Lu HC, Chou ML, Chen LC, Ou CI, Liao DC, Yeh YY, Chang SB, Shen SC, Wu FH, Shih MC,Chan MT (2013) Plant Mol Biol,