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Global transcriptome analysis and identification of a CONSTANS-like gene family in the orchid Erycina pusilla

Global transcriptome analysis and identification of a CONSTANS-like gene family in the orchid Erycina pusilla相片
Global transcriptome analysis and identification of a CONSTANS-like gene family in the orchid Erycina pusilla相片
蘭科植物扇形文心蘭(Erycina pusilla)具有較少數量的染色體(2n = 12)，而且利用組織培養技術可在一年內開花，這些特點使扇形文心蘭適合成為蘭科的模式植物。在這篇研究中，利用次世代定序技術並藉由生物資訊重整，我們獲得90,668基因片斷(unigenes)。並用生物資訊的分析將這些基因片斷進行分析。使用這個資訊，我們將開花的關鍵性同源基因CONSTANS (CO)基因群找出來。一共獲得12個扇形文心蘭CO-Like (EpCOL)基因的全長。基於基因序列的同源性、蛋白質同源區域的結構以及系統發生學分析，這些EpCOL基因被分為四群。這四群EpCOL接上綠色螢光蛋白後顯示其表現位置在細胞核。有些EpCOL受到光線條控。這些結果顯示，扇形文心蘭轉錄體學與BAC基因庫可以進一步可應用於蘭花的其他生物學途徑、產銷特性以及分子育種學的研究。

Chou ML, Shih MC, Chan MT, Liao SY, Hsu CT, Haung YT, Chen JJ, Liao DC, Wu FH, Lin CS (2013) Planta,