RNA降解組中外顯子連接複合體足跡可作為轉譯前RNA降解的標記

RNA降解組由來自不同降解路徑的RNA降解中間產物所組成，但如何解讀各式產物的意義，所知甚少。本研究為首次報導，在多個動植物物種的RNA降解組中，存在外顯子連接複合體 (exon junction complexes, EJC)之足跡。在RNA剪接過程中，EJC被置放於RNA上，但在RNA首次轉譯過程中即被移除。若RNA在首次轉譯完成前被降解，EJC會阻擋RNA自5端往3端方向的分解，進而留下被EJC保護的降解中間產物，也就是EJC足跡。所以，此特殊降解產物可作為RNA在首次轉譯完成前被降解的證據。經由分析EJC足跡，我們證實在植物上百個無義介導mRNA降解的標的，及多個微核糖核酸標的RNA的降解，皆發生在首次轉譯完成前。此發現為RNA降解在何時發生，帶來新的洞見及研究工具。