透過美洲與歐洲白楊樹基因體與族群定序了解楊屬植物功能與演化差異

我們分別對兩個具有高度遺傳變異的美洲與歐洲楊屬(Populus)植物進行全基因體解序。我們發現正向與負向選擇廣泛影響遺傳變異，但是對編碼序列與非編碼序列間的影響程度不同，另外選擇的強度與遺傳變異的程度，與基因表現和共同基因表現網路的連接性有強烈關聯。這些結果揭示了無論是正向或負向選擇皆對異交且多年生的植物的全基因體遺傳變異程度有重要影響。這些基因體資料，建立了以白楊樹作為模式植物研究的基礎，提供未來以基因體學更深入了解適應演化的基石。所有的基因體資料皆可以於PopGenIE資料庫公開下載 (PopGenIE.org).
林耀正

Lin, Y.-C. , Wang, J., Delhomme, N., Schiffthaler, B., Sundström, G., Zuccolo, A., Nystedt, B., Hvidsten, T. R., de la Torre, A., Cossu, R. M., Hoeppner, M. P., Lantz, H., Scofield, D. G., Zamani, N., Johansson, A., Mannapperuma, C., Robinson, K. M., Mähler, N., Leitch, I. J., Pellicer, J., Park, E.-J., Van Montagu, M., Van de Peer, Y., Grabherr, M., Jansson, S., Ingvarsson, P. K. and Street, N. R (2018) PNAS,