發展新穎核酸鍵結體分析工具FeatureHunter於暴露體學研究之快速核酸修飾識別與分類

生物體當暴露在可與核酸作用的物理和化學因子下，可能會導致DNA與RNA的修飾(又稱NA Modifications)，此作用已知與多種疾病有關，包括癌症。近期，新興研究核酸鍵結體學(NA Adductomics)的方向已開始著重在識別目前已知和未知的核酸修飾，而此方向的主要挑戰為如何大量處理由高分辨率串聯質譜儀(HR-MS/MS)所產生的複雜數據。為了解決此問題，我們開發了一款名為“FeatureHunter”的軟體，該軟體可根據使用者定義的核酸修飾特徵，自質譜儀獲取的一次和二次圖譜，自動判別出不同類型的核酸鍵結體，並加以標註和分類。

我們藉由分析由實驗室產生或臨床的樣本，來展示FeatureHunter找出多種核酸修飾的功能與效果。我們成功展示在核酸鍵結體的分析中，FeatureHunter為一個強大的核酸修飾識別和分類的工具，並為環境暴露學(Exposome)提供了一個有價值的資源。

https://msomics.abrc.sinica.edu.tw/FeatureHunter/

陳逸然

胡瓊文#, 張元哲#, 張瑋宏#, Marcus S. Cooke, 陳逸然*, and 趙木榮* (2024) 發展新穎核酸鍵結體分析工具FeatureHunter於暴露體學研究之快速核酸修飾識別與分類 Environmental Science & Technology, 2024, 58, 1, 75–89, https://doi.org/10.1021/acs.est.3c04674