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RNA降解組中外顯子連接複合體足跡可作為轉譯前RNA降解的標記

RNA降解組由來自不同降解路徑的RNA降解中間產物所組成,但如何解讀各式產物的意義,所知甚少。本研究為首次報導,在多個動植物物種的RNA降解組中,存在外顯子連接複合體 (exon junction complexes, EJC)之足跡。在RNA剪接過程中,EJC被置放於RNA上,但在RNA首次轉譯過程中即被移除。若RNA在首次轉譯完成前被降解,EJC會阻擋RNA自5端往3端方向的分解,進而留下被EJC保護的降解中間產物,也就是EJC足跡。所以,此特殊降解產物可作為RNA在首次轉譯完成前被降解的證據。經由分析EJC足跡,我們證實在植物上百個無義介導mRNA降解的標的,及多個微核糖核酸標的RNA的降解,皆發生在首次轉譯完成前。此發現為RNA降解在何時發生,帶來新的洞見及研究工具。