2030年的阿拉伯介之研究:可電腦計算植物的轉化
植物對人類生存至關重要。在過去三十年中,以模式植物**阿拉伯芥(Arabidopsis thaliana)**為對象的研究大幅推動了植物生物學的進展。其中一個關鍵事件是25年前該植物基因組的測序,這一突破促成了許多後續的研究技術和數據集的發展。阿拉伯芥在闡明植物特有的生物學機制、開發研究工具以及將研...
CIPK15通過抑制NH4+運輸保護阿拉伯芥免受淹水威脅
眾所皆知氮源(Nitrogen)對於植物來說非常重要,因為它們是核酸、胺基酸和蛋白質等重要大分子的構成要素。在大多數土壤中,氮主要以無機形式存在(例如:硝酸鹽,NO3−和銨離子,NH4+)。已有多項研究顯示,土壤中的氮含量對植物的生長和發育產生顯著影響。然而,當植物處於缺氧的淹水環境中時,硝酸鹽(N...
硝酸鹽的螢光生物傳感器nlsNiMet3.0使用手冊
2022年,何承訓博士帶領實驗室團隊於期刊Science Advances發表了第一個偵測植物體內硝酸鹽(NO3–)的螢光共振能量轉移(FRET)傳感器,(全文連結:https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abq4915)。為了讓大家能夠更了解傳感器的使...
運用螢光轉運活性生物感測器的概念證明阿拉伯芥NPF1.3對硝酸鹽的活性
阿拉伯芥的NRT1/PTR家族(NPF)作為硝酸鹽轉運蛋白扮演重要角色。第一個硝酸鹽轉運蛋白活性生物感測器—NiTrac1藉由結合雙親和性的硝酸鹽轉運受器—NPF6.3作為螢光活性感測器。此研究中,我們成功的將此概念運用至NPF家族中的其他成員。利用基因編碼螢光轉運活性感側器的篩選,我們將NPF1....
硝酸鹽動態的直播秀-創新的基因編碼螢光共振的生物感測器
硝酸鹽 (NO3-) 的吸收和分佈對植物生命與作物產量至關重要。儘管已經充分研究了各種細胞中硝酸鹽攝取的上游調節和下游對硝酸鹽的反應,但硝酸鹽在細胞中或植物體中的空間和時間分佈,例如:濃度變化與動態分佈仍然無法窺探。原因是缺乏適當的測量工具。本中心農業生物科技研究中心何承訓助研究員團隊,研發出第一個...
運用螢光轉運活性生物感測器的概念證明阿拉伯芥NPF1.3對硝酸鹽的活性
阿拉伯芥的NRT1/PTR家族(NPF)作為硝酸鹽轉運蛋白扮演重要角色。第一個硝酸鹽轉運蛋白活性生物感測器—NiTrac1藉由結合雙親和性的硝酸鹽轉運受器—NPF6.3作為螢光活性感測器。此研究中,我們成功的將此概念運用至NPF家族中的其他成員。利用基因編碼螢光轉運活性感側器的篩選,我們將NPF1....
基因編碼螢光傳感器用於探索植物生物學的設計、應用和限制
要了解多細胞生物中的信號傳導和代謝過程需要了解小分子的空間動力學和體內酶、轉運蛋白和其他蛋白質的活性,以及細胞內和組織內的生物物理參數。受體、配體和激活狀態的細胞分佈必須與代謝物的細胞分佈信息相結合,與代謝通量和信號動力學有關,以實現體內生物化學的前景。基因編碼傳感器是工程螢光蛋白,已針對各種小分子...
基因編碼螢光傳感器用於探索植物生物學的設計、應用和限制。
要了解多細胞生物中的信號傳導和代謝過程需要了解小分子的空間動力學和體內酶、轉運蛋白和其他蛋白質的活性,以及細胞內和組織內的生物物理參數。受體、配體和激活狀態的細胞分佈必須與代謝物的細胞分佈信息相結合,與代謝通量和信號動力學有關,以實現體內生物化學的前景。基因編碼傳感器是工程螢光蛋白,已針對各種小分子...
CIPK15磷酸酶調控AMT1 NH4+ 轉運蛋白的反饋抑制與去毒化機制
背景:銨(NH4+)是一種關鍵重要氮肥,但當其積累到很高的程度時對生物體會產生毒性。銨轉運蛋白(AMT)是負責吸收NH4+ 的關鍵轉運蛋白。 AMT的活性受變構反饋控制,由胞質C端(CCT)中蘇氨酸的磷酸化誘導。然而,負責NH4+ 觸發的磷...
TRANSPORTER OF IBA1 Links Auxin and Cytokininto Influence Root Architecture
控制根系結構的發育過程對植物進行土壤勘探至關重要,可以吸收水分和養分。 生長素前體吲哚-3-丁酸(IBA)轉化為活性生長素(吲哚-3-乙酸; IAA)調節側根形成。 然而,尚未闡明控制IBA-IAA轉化的機制。 我們將IBA1轉運蛋白(TO...
Ratiometric Matryoshka 生物傳感器-嵌套組合式的綠色和橙色發射螢光蛋白
敏感性,動態和檢測範圍以及排除表現量和儀器偽影對於以螢光蛋白(FP)為基質的生物傳感器在體內獲得的數據的定量是至關重要的。目前的生物傳感器設計通常不能同時滿足所有這些標準。在這裡,我們描述了一個可推廣的平台,通過採用名為GO-(Green-...
酵母培養物中硝酸鹽與肽轉運蛋白螢光活性蛋白傳感器的設計與功能分析
此protocol描述了用於在酵母細胞中設計和部署用於硝酸鹽和肽轉運蛋白活性的遺傳編碼的螢光活性傳感器的方法。將雙親硝酸鹽轉運體CHL1 / AtNRT1.1 / AtNPF6.3或四種不同的肽轉運蛋白(AtPTR1,2,4和5)從阿拉伯芥融合到具有不同光譜性質的一對螢光蛋白,使我們能夠設計NiTr...